1.中心实行主任负责制，副主任协助主任工作，目前配备主任1名，副主任3名（执行主任1名、副主任2名）。

2.学校成立了建设领导小组和工作小组，全面负责中心的建设工作。

3.校实验室与设备管理处等职能部门定期检查中心运行情况，并对实验中心主任、副主任进行考核。

4.中心成立实验教学督导组，聘请教学经验丰富的教授为督导组成员，负责对实验教学进行监督和指导。

5.实验教学人员实行竞争上岗、滚动管理、定期考核的管理机制，中心还制定了实验技术人员考核管理办法。

6.实行教育教学资源统筹调配、资源共享、高效使用的智能化、网络化管理模式。